Tipograļ¬ Universitas Atma Jaya Yogyakarta menggunakan Eras UAJY BT Demi, sebuah huruf sans serif yang memiliki ciri khas otentik berkarakter kuat. Sedangkan untuk semboyan menggunakan huruf Tempus Sans, yaitu huruf alternatif dari desain romawi klasik dengan tepi yang kasar. Huruf ini memiliki kesan kerja keras dan perjuangan penuh ikhlas sehingga tak tergantikan dan sangat selaras dengan makna semboyan “serviens in lumine veritatis”.